不知道你这个合作建房是什么性质

首先你要看，你这个合作建房是否去备案，是否有施工许可证，是否有预售许可证，如果这些都没有，基本可以断定，你这套3楼的房子是办不下来房产证的。

先前你买的是私房，也就是说2层的房子是作为一个整体配备一个房产证的，你买了其中一层，根本就是私下交易，没经官方认定的产权转移本身就有瑕疵。

现在又是合作建房，如果未经审批，基本上房产证是没有希望了。私下交易的事情，肯定也受法律保护，至于房产证，是根本不可能的事。就算打官司，也不会支持，本身这个约定就是子虚乌有，只能请求赔偿了。